| Direction Départementale du Développement (DDD) | DDD-MDC |
| Direction Départementale du Travail et de la Fonction Publique | DDTFP-MTFP |
| Direction Générale de l' Évaluation et de l'Observatoire du Changement Social (DGEOCS) | DGEOCS-MDC |
| Direction Générale de la Caisse Autonome d'Amortissement | CAA-MEF |
| Direction Générale de la Caisse des Dépôts et Consignation (DGCDC) | CDCB-MEF |
| Direction Générale de la Construction et de l’Habitat | DGCH-MCVT |
| Direction Générale de la Coordination et du Suivi des Objectifs de Développement Durable (DGCS-ODD) | DGCS-ODD-MDC |
| Direction Générale de la Fonction Publique | DGFP-MTFP |
| Direction Générale de la Loterie Nationale du Bénin (LNB) | LNB-MEF |
| Direction Générale de la Microfinance | DGM |
| Direction Générale de la Médecine Hospitalière et des Explorations Diagnostiques | DGMHED-MS |
| Direction Générale de la Recherche Scientifique et de l'Innovation | DGRSI-MESRS |
| Direction Générale de la Réforme de l’Etat | DGRE-MTFP |
| Direction Générale de l’Eau | DGEau-MEEM |
| Direction Générale de l’Enseignement Supérieur | DGES-MESRS |
| Direction Générale de l’Environnement et du Climat | DGEC-MCVT |
| Direction Générale des Affaires Economiques | DGAE-MEF |
| Direction Générale des Affaires Sociales | DGFAS-MASM |
| Direction Générale des Douanes | DGD |
| Direction Générale des Eaux, Forêts et Chasse | DGEFC-MCVT |